Управление архива и фондов
- Фондохранилище
- Отдел архивации
- Отдел изученности
- Отдел учета и хранения лицензионных материалов
- Отдел мониторинга геологической информации
- Отдел проверки поступающей геологической информации
- Отдел геологической информации на вещественных носителях
Управление информационно-аналитического обеспечения МСБ ТПИ и ГКМ
- Отдел анализа МСБ ТПИ
- Отдел подготовки государственных балансов твердых полезных ископаемых
- Отдел подготовки государственных балансов твердых горючих полезных ископаемых
- Отдел подготовки ГКМ
Управление информационно-аналитического обеспечения МСБ УВС и ПВ
- Отдел анализа МСБ УВС и ПВ
- Отдел подготовки государственных балансов УВС
- Отдел подготовки государственных балансов ПВ
Управление информационных технологий
- Отдел создания и развития отраслевых ИС
- Отдел межведомственного взаимодействия
- Отдел нормативно-методического обеспечения информатизации
- Отдел геоинформационного обеспечения
Управление формирования и ведения ФГИС «ЕФГИ»
- Отдел создания и развития ФГИС «ЕФГИ»
- Отдел ведения реестра ФГИС «ЕФГИ»
- Отдел формирования банка данных первичной и интерпретированной геологической информации
Управление технического и программного обеспечения
- Отдел внедрения и сопровождения фондовых ИС и прикладного ПО
- Отдел внедрения и сопровождения отраслевых ИС
- Отдел технического обеспечения
- Отдел подготовки и выпуска готовой продукции
Филиал и отделения
- Морской филиал ФГБУ «Росгеолфонд»
- Калужское отделение ФГБУ «Росгеолфонд»
- Сибирское отделение ФГБУ «Росгеолфонд»